為什么蛋白實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性差?為什么明明是同一管樣品,再次使用就沒有結(jié)果了呢?當(dāng)你還在冥思苦想的時候,蛋白可能已經(jīng)在悄悄降解了……
圖1 蛋白降解圖
世界上沒有兩個完全一樣的東西,正如世界上不會出現(xiàn)兩個降解程度一模一樣的蛋白。
如圖1所示,不同樣品甚至不同泳道上的蛋白降解程度都是不一樣的。泳道2中蛋白降解非常嚴(yán)重,以至于在顯影后無法檢測到;泳道3-1,3-2中蛋白部分降解,顯影后下方出現(xiàn)降解條帶,當(dāng)?shù)鞍捉到獬潭仍僦貢r,會出現(xiàn)不同長度的蛋白降解條帶,呈現(xiàn)彌散狀或直接無法檢測。
在體外研究中,蛋白合成過程終止后,降解作用大大增強(qiáng),其中蛋白酶在蛋白降解過程中發(fā)揮著重要作用。
蛋白酶是水解蛋白質(zhì)肽鏈的一類酶的總稱,主要作用是催化蛋白質(zhì)水解。
按其水解多肽的方式,可以將其分為內(nèi)肽酶和外肽酶兩類。內(nèi)肽酶作用于蛋白質(zhì)多肽鏈的內(nèi)部,可以在特定肽鍵處切割,產(chǎn)生多個較小的肽段;外肽酶則作用于蛋白質(zhì)或多肽鏈的末端,逐個將肽鍵水解,釋放出單個的氨基酸。按其作用活性中心,又可將蛋白酶分為絲氨酸蛋白酶、半胱氨酸蛋白酶、天冬氨酸蛋白酶和金屬蛋白酶等。
為了保護(hù)蛋白,降低蛋白降解的風(fēng)險,在實(shí)驗(yàn)中抑制蛋白酶的活性便是首要的任務(wù),因此蛋白酶抑制劑身擔(dān)重任。
根據(jù)氨基酸序列的同源性和靶向蛋白酶的不同,蛋白酶抑制劑可分為絲氨酸蛋白酶抑制劑、半胱氨酸蛋白酶抑制劑、天冬氨酸蛋白酶抑制劑以及金屬蛋白酶抑制劑。
實(shí)驗(yàn)中常用的PMSF(苯甲基磺酰氟)就是一種絲氨酸蛋白酶抑制劑,它會特異性的結(jié)合到絲氨酸蛋白酶的活性區(qū)域,從而抑制蛋白酶的作用,保護(hù)蛋白。
但是在實(shí)驗(yàn)過程中,不同類型的蛋白提取物中會含有不同類型的蛋白酶。例如,哺乳動物細(xì)胞提取物中通常含有高豐度的絲氨酸蛋白酶,哺乳動物組織提取物中主要含有絲氨酸、半胱氨酸和金屬蛋白酶,細(xì)菌提取物通常含有較多的絲氨酸蛋白酶和金屬蛋白酶,植物提取物中常含有大量的絲氨酸和半胱氨酸蛋白酶,還有一些含有天冬氨酸蛋白酶。
由此可知,在種類多樣的實(shí)驗(yàn)樣本前,單一的蛋白酶抑制劑已經(jīng)不能滿足實(shí)驗(yàn)要求了,于是蛋白酶抑制劑cocktail應(yīng)時而生,其含有多種蛋白酶抑制劑成分,能同時抑制多種蛋白酶活性,對蛋白的保護(hù)更加全面。
思科捷【SJ-MK0001】Protease Inhibitor Cocktail (EDTA-Free,100× in DMSO)已經(jīng)上新???
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